本月我接种疫苗第二剂。分析完课题相关数据,为了验证分析结果的可重复性。由于在Lunix操作系统下,系统配置要求较高,为了增加系统数据分析的稳定性,采用docker进行数据分析,可以提高分析数据的自动化和稳定性。
现在将这月的主要工作情况总结如下:
一、学习方面
主要学习Docker分析过程及理论知识。
(一)阅读文献
主要阅读关于docker的结构及操作命令,及分析流程。
(二)数据处理
利用docker nfcore/ methylseq, nfcore/ chipseq, nfcore/atacseq, nfcore/rnaseq重新分析以前的数据,但是分析过程中发现需要满足至少8 个core,100GB以上RAM,500GB以上的存储空间,否则运行在中途中断,我继续配置了8个core, 128GB的RAM, 4TB的电脑。然后再运行docker,发现运行这些数据更加自动化,可以直接获得分析结果。这样为将来的数据分析提高效率。